La deuxième année de master est ouverte aux étudiants détenteurs d'une première année de master ou titre équivalent à dominante Ecologie, Evolution, Mathématiques Appliquées à la Biologie, Bioinformatique, etc. Le Master 2 est indifférencié et se caractérise par l'existence de deux parcours :

• Ecologie, Evolution, Génomique destiné à former des étudiants au monde de la recherche
• Bioévaluation des Ecosystèmes et Expertise de la Biodiversité destiné à former des étudiants à la gestion des espaces naturels et anthropisés.

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• Wilson ML, Miller CM & Crouse KN (2018) Humans as model species for sexual selection research. Proc. R. Soc. B 284: 20171320
• Courchamp F & Bradshaw CJA (2017) 100 articles every ecologists should read. Nature Ecology & Evolution, doi:10.1038/s41559-017-0370-9
• E bath et al. (2017) Sperm and sex peptide stimulate aggression in female Drosophila. Nature Ecology & Evolution, 1, 0154, doi:10.1038/s41559-017-0154
• Morgante et al, (2015) Genetic Architecture of Micro-Environmental Plasticity in Drosophila melanogaster, Scientific reports (doi:10.1038/srep09785)
• Dingemanse NJ & Araya-Ajoy (2016) Interacting personalities: behavioural ecology meets quantitative genetics. TREE. http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2014.12.00